La Farnesina fu costruita per volere del banchiere Agostino Chigi (1465-1520), che chiamò per la realizzazione del progetto nel 1505, Baldassarre Peruzzi. Il sito scelto era di grande amenità, posto su via della Lungara, tra il Gianicolo e il Tevere.
La villa venne ceduta nel 1579 al card. Alessandro Farnese, nipote di Paolo V, da cui prese la denominazione che conserva tutt’oggi. Nel 1927 la villa fu venduta allo Stato Italiano. Alla decorazione della villa partecipò Raffaello, autore (insieme ai suoi allievi Raffaellino del Colle, Giovanni Francesco Penni, Giulio Romano e Giovanni da Udine) degli affreschi della Sala di Psiche con le Storie di Amore e Psiche, tratte dall’Asino d’Oro di Apuleio, e dell’affresco del Trionfo di Galatea nella Loggia di Galatea.
Si possono ammirare anche le dodici lunette di Sebastiano del Piombo con storie tratte dalle Metamorfosi di Ovidio e il Polifemo. Al piano nobile, tra il 1512 e il 1514, il Sodoma realizzò nella camera nuziale del Chigi gli affreschi con le Storie della vita di Alessandro Magno mentre il Peruzzi ideò la decorazione della Saletta del Fregio e del Salone delle Prospettive, tra le prime di questo genere. Durante il Sacco di Roma la villa fu occupata e deturpata dai Lanzichenecchi, come testimoniano alcuni graffiti. E’ considerata la prima villa extra-urbana di Roma.